La sezione da noi visitata è quella di Zoologia - collezione vertebrati. Contiene 10.000 esemplari disposti secondo il numero progressivo di inventario per facilitarne la consultazione. Per molti di essi, attraverso le documentazioni archivistiche, è possibile la ricostruzione del percorso storico. Tra i preparati di epoca spallanziana che ancora si conservano, sono rilevanti un coccodrillo del Nilo e un ippopotamo giunto da Mantova nel 1783.
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