Il museo è costituito da due sezioni: quella di Fisica e quella di Medicina. La sezione di Fisica ospita una ricca collezione di strumenti appartenenti all'originario Gabinetto di Fisica di A. Volta. Su un lato della sala, due tavoli da lavoro appartenenti allo stesso Volta ospitano alcuni esemplari dei numerosi strumenti che egli utilizzò per investigare le proprietà della carica elettrica e dei corpi elettrizzati.
La sezione di Medicina si articola in tre sale intitolate a grandi maestri della Medicina: Antonio Scarpa, Luigi Porta e Camillo Golgi. Il materiale anatomico, che costituisce la parte preponderante delle collezioni, è costituito da preparati in parte a secco e in parte conservati in alcool o in soluzione di formaldeide, realizzati allo scopo di illustrare particolari interventi chirurgici o per mostrare distretti anatomici di peculiare interesse.
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